Trombolitik tedavinin başlıca riski iç kanamadır. Trombolitik tedavi gören kişilerin yaklaşık %5'inde ciddi kanamalar, yaklaşık %1'inde ise felce neden olan beyin kanamaları görülür. Diğer riskler şunlardır:
- Alerjik reaksiyonlar .
- Burunda , dışkıda veya idrarda kanama .
- IV veya kateter giriş yerinde kanama veya morarma .
- Özellikle diyabet hastasılarında böbrek hasarı .
- Düşük kan basıncı ( hipotansiyon ).
- Kan pıhtısının vücudun başka bir yerine hareket etmesi.
- Şişmiş doku ( anjiyoödem ).
- Ventriküler aritmi