Gırtlak kanseri başladığı hücre tipine göre çeşitlerine ayrılmaktadır.
- Skuamöz hücre tipi gırtlak kanseri: Gırtlak kanserinin neredeyse %95 kanseri bu tiptir. Epiglot denilen gırtlağın üst kısmında ince, yaprak şeklindeki kapakta bulunan düz yassı hücrelerde veya gırtlağın diğer kısımlarında aynı yapıdaki hücrelerde başlar.
- Glottik kanser - ses tellerinde başlar
- Supraglottik kanser - ses tellerinin üst kısmında başlar
- Subglottik kanser - ses tellerinin altında başlar
- Orofarengeal kanser - ağzın hemen arka kısmında başlar
- Nazofarengeal kanser - boğazın arka kısmında başlar
- Adenokarsinom gırtlak kanseri: Son yıllarda görülme sayısı artmasına rağmen skuamöz hücre tipi gırtlak kanserine göre çok daha nadir görülür. Gırtlak yüzeyine dağılmış mukus üreten adenomatöz hücrelerde başlar.