Kekik suyu genellikle güvenlidir ancak aşırı kullanımı mide rahatsızlıklarına neden olabilir. Ayrıca, bazı kişilerde alerjik reaksiyonlara veya cilt tahrişine yol açabilir. Hamile ve emziren kadınlar ile kan sulandırıcı ilaç kullanan kişilerin kullanmadan önce doktorlarına danışmaları önerilir.
