Bağırsak enfeksiyonu, bağırsak ya da midede bir dizi bakteri, virüs ve parazitin neden olduğu gastrointestinal sistemin iltihaplanmasıdır. Bu mikrobiyolojik ajanlar genellikle besin veya su tüketimi ile bulaşırlar. Bağırsak enfeksiyonu tıbben gastroenterit olarak da bilinmektedir. İshal, karın ağrısı ve ateş yaygın belirtileridir.