Lobektomi işlemi hasta seçimine ve endikasyona uygun şekilde yapıldığında, genellikle bir risk taşımamaktadır. Ancak genel olarak lobektomi ameliyatının olası risk ve yan etkileri şu şekilde sıralanabilir:
- Kapalı ameliyatlar gerektiğinde açık cerrahiye döndürülebilir, bu durumda kanamadan dolayı kan nakli gerekebilir
- Akciğerlerde 7 günden uzun süren kalıcı bir hava kaçağı oluşabilir
- Bacaklarda kan pıhtısı oluşabilir
- Kalp ritim bozukluğu oluşabilir
- Diyaframı veya ses tellerini etkileyebilecek sinir yaralanmaları görülebilir
- Enfeksiyon meydana gelebilir
- Akciğer ile iç göğüs duvarı arasındaki boşlukta sıvı birikebilir (plevral efüzyon)