HPV virüsünün en belirgin belirtileri, genital bölge ve anüs başta olmak üzere ağız ve boğazda siğil oluşumu ile karakterize anormal hücre büyümeleri ve yara oluşumudur. Genital ve anüs bölgesindeki siğillerin görünüşleri karnabaharı andırabilir. Rahim ağzı kanseri de HPV'nin bir belirtisi olabilir.
