EPS işlemi her hasta için uygun değildir. İşlem gerçekleştirmeden önce kişinin genel sağlık durumunun değerlendirilmesi gerekir. Enfeksiyon hastalıkları söz konusu ise bu işlemin uygulanmaması önerilir. Kanında pıhtılaşma olan kişiler için de uygun bir işlem olmadığı bilinir. Hamilelik sürecindeki kadınlar için ise bu işlemin ekstra dikkatli bir şekilde uygulanması gerekir.
